DNA序列的校对几次的结果不同,怎样才得到正确的结果转换?
2016-09-13技术资料
我在日本做分子测序之类的实验。
以前国内是PCR产物直接给公司,公司给结果。
我这裡是自己PCR,随后sequence,得到正反引物的两条链的结果。
但是仪器会有误差,或者引物造成的误差,所以导师都是要求我们测几次。
我想问
几次的结果不同,我怎样才能校对序列,得到正确的结果转换
是不是要看Chromas上的峰图准确不呢
没错,进行序列比对之后,如果发现不一样的,就要拿峰图来判断,
同一个sample,第一次和第二次的序列,我用bioedit看的,波形都挺好的,但是就是不一样。。。
同样求助,我 也遇到类似问题,不过不是自己测序
有没有可能是多拷贝的问题?
说是dna机器会失误。。。。所以多测几次。。。。
没错,进行序列比对之后,如果发现不一样的,就要拿峰图来判断,
将有分歧的对应序列翻译成氨基酸 再将氨基酸reverse translate 为兼并性碱基 若有差异的碱基不是在保守位置上 那都是可接受的
在此基础上继续搜索 将你所研究的基因在其他物种上所对应的序列比对一下 看看差异是位于保守区还是可变区 再斟酌下下 应该可以解决大部分的测序差异
不知道我的意思表达得到位不 也不知道你会看明白不 希望对你有帮助
在此基础上继续搜索 将你所研究的基因在其他物种上所对应的序列比对一下 看看差异是位于保守区还是可变区 再斟酌下下 应该可以解决大部分的测序差异
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